在正常情况下，出口货物原产地证明书应该在货物出运之前申请办理，但如果是由于合理原因并符合相关的签证要求，申请人可以在货物出运后申请办理补发、重发、更改原产地证书，但对于签证机构无法核实原产地的已出运货物，不予签发原产地证书。
一、补发证
1、申请补发证应提供以下资料：
申请补发证书的书面说明;
货物出口报关单、提单等资料;
签证机构要求的其他证明文件。
2、签证机构在证书的签证机构使用栏注明“补发”字样
(GSP\CO:ISSUEEDRETROSPECTIVELY、其他优惠证明书ISSUEDRETRACTIVELY),亚太、秘鲁证没有规定。
证书名称补发要求
FORMF 货物出运后30天内
FORMN/R 没有规定可以补发
FORMP 货物出运后15天内
FORMA 日本不接受后发证。
二、重发证书
已签发的证书正本遗失或毁损，申请人可在证书有效期内申请重发证书，申请时应提供如下资料：
申请补发证书的书面说明;
遗失证书副本或复印件(若有);
全国性报纸(如：国门时报等)登载的原发证书作废声明的证明文件;
货物出口提单等资料;
签证机构要求的其他证明文件。
2.重发证书的申请日期和签证日期应是实际申请、签发日期。
三、更改证书
已经签发的原产地证明书内容发生变更，可在原签证书有效期内提出更改，并提供以下资料：
申办更改证书的申请书;
原发证书或者申办证书的全套资料(已缴费但证书未打印的情况)
签证机构要求的其他证明文件。
更改证书号码与新证书编号规则一致，但改变流水号，申请日期同原证日期一致。
更改证书在未付费的情况下，可以要求退回修改。
