【性状鉴别】
川黄柏
① 呈板片状或浅槽状，长宽不等，厚3mm～7mm.
② 外表面黄棕色或黄褐色，较平坦，皮孔横生，嫩皮较明显，有不规则的纵向浅裂纹，偶有残存的灰褐色的粗皮。
③ 内表面暗黄色或黄棕色，具细密的纵纹。体轻，质较硬，断面深黄色，裂片状分层，纤维性。
④ 气微，味苦；粘液性，可使唾液染成黄色。
关黄柏
通常较川黄柏薄，厚约2mm～4mm.外表面深黄棕色，具不规则的纵裂纹，时有暗灰色的栓皮残留，栓皮厚，有弹性，皮孔小而少见，内表面黄色或黄棕色。体轻，质硬，断面鲜黄色或黄绿色。
均以皮厚、断面色黄者为佳。
【显微鉴别】
川黄柏横切面
① 未去净外皮者，木栓层由多列长方形细胞组成，内含棕色物质。栓内层细胞中含草酸钙方晶。
② 皮层比较狭窄，散有纤维群及石细胞群，石细胞大多分枝状，壁极厚，层纹明显。
③ 韧皮部占树皮的极大部分，外侧有少数石细胞，纤维束切向排列呈断续的层带，纤维束周围薄壁细胞中常含草酸钙方晶。
④ 射线宽2～4列细胞，常弯曲而细长。薄壁细胞中含有细小的淀粉粒，粘液细胞随处可见。
关黄柏与川黄柏相似，不同点是：关黄柏木栓细胞呈方形，皮层比较宽广，石细胞较川黄柏略少，射线较平直，硬韧部不甚发达。
关黄柏粉末：呈绿黄色或黄色。
① 石细胞众多，鲜黄色，长圆形、纺锤形或长条形，直径35μm～80μm，有的呈分枝状，枝端钝尖，壁厚，层纹明显。
② 纤维鲜黄色，直径16μm～38μm，常成束，周围的细胞含草酸钙方晶，形成晶纤维。
③ 草酸钙方晶极多，直径12μm～24μm～30μm.
④ 淀粉粒细小。
⑤ 粘液细胞可见，呈类球形，直径32μm～42μm.
川黄柏不同于关黄柏的特征是：石细胞大多呈分枝状，呈圆形者直径40μm～128μm，孔沟不明显。黄色粘液细胞多单个散离，遇水渐膨胀呈类圆形或矩圆形，直径40μm～72μm，壁薄，有时胀裂，胞腔可见无定形粘液质。
【成分】
关黄柏树皮含多种生物碱，主要为小檗碱（berberine）约0.6％～2.5％，并含少量黄柏碱（phellodendrine）、木兰碱（magnof1orine）、掌叶防己碱（即棕榈碱，palmatine）等，另含苦味质黄柏酮、黄柏内酯（即柠檬苦素）、白鲜内酯、青荧光酸等。此外，还有α-及β-谷甾醇、豆甾醇等。
川黄柏树皮含小檗碱约1.4％～5.8％、黄柏碱、木兰碱、掌叶防己碱等生物碱。
【理化鉴别】
取黄柏断面，置紫外光灯下观察，显亮黄色荧光。
取粉末1g，加乙醚10ml，振摇后，分取浸出液，挥去乙醚，残渣加冰醋酸使溶解，再加浓硫酸1滴，放置，溶液呈紫棕色，（黄柏酮及植物甾醇的反应）
取粉末0.1g，加乙醇10ml，振摇数分钟，滤过，滤液加硫酸1ml，沿管壁滴加氯试液1ml，在两液接界处显红色环。（检查小檗碱）
本品粉末的甲醇提取液作供试品溶液，另取黄柏对照药材的乙醇提取液，再取小檗碱对照品溶液，分别点于同一硅胶G薄层板上，以苯-醋酸乙酯-甲醇-异丙醇-浓氨试液（6：3：1.5：1.5：0.5）为展开剂，置氨蒸气饱和的层析缸内展开，置紫外光灯（365nm）下观察，供试品色谱中，在与对照药材及对照品色谱相应的位置上，显相同的斑点。
